Here is a pretty vast list of Japanese names for various countries and regions. Should cover most countries you have only heard of

Afghanistan – アフガニスタン – afuganisutan
Albania – アルバニア – arubania
Algeria – アルジェリア – arujeria
America – アメリカ – amerika
Angola – アンゴラ – angora
Argentina – アルゼンチン – aruzenchin
Armenia – アルメニア – arumenia
Australia – オーストラリア – oosutoraria
Austria – オーストリア – oosutoria
Azerbaijan – アゼルバイジャン – azerubaijan

Bahrain – バーレーン – baareen
Bangladesh – バングラデシュ – banguradeshu
Barbados – バルバドス – barubadosu
Belarus – ベラルーシュ – beraruushu
Belgium – ベルギー – berugii
Bermuda – バミューダ – bamyuuda
Bhutan – ブータン – buutan
Bolivia – ボリビア – boribia
Bosnia and Herzgovina – ボスニア・ヘルツゴビナ – bosunia herutsugobina
Botswana – ボツワナ – botsuwana
Brazil – ブラジル – burajiru
Bulgaria – ブルガリア – burugaria

Cambodia – カンボジア – kanbojia
Cameroon – カメルーン – kameruun
Canada – カナダ – kanada
Cayman Islands – ケイマン諸島（しょとう） – keiman shotou
Chad – チャド – chado
Chile – チリ – chiri
China – 中国（ちゅうごく） – chuugokuChristmas Islan..Cocos
Colombia – コロンビア – koronbia
Cook Islands – クック諸島（しょとう） – kukku shotou
Costa Rica – コスタリカ – kosutarika
Cote d’Ivoire – コートジボワール – kootojibowaaru
Croatia – クロアチア – kuroachia
Cuba – キューバ – kyuuba
Cyprus – キプロス – kipurosu
Czech Republic – チェコ – cheko

Denmark – デンマーク – denmaaku
Dominica – ドミニカ – dominika

East Timor – 東（ひがし）チモール – higashi chimooru
Ecuador – エクアドル – ekuadoru
Egypt – エジプト – ejiputo
El Salvador – エルサルバドル – erusarubadoru
Estonia – エストニア – esutonia
Ethiopia – エチオピア – echiopia
Fiji – フィジー – fijii
Finland – フィンランド – finrando
France – フランス – furansu

Gabon – ガボン – gabon
Georgia – ジョージア – joojia
Germany – ドイツ – doitsu
Ghana – ガーナ – gaana
Gibraltar – ジブラルタル – jiburarutaru
Greece – ギリシア – girishia
Greenland – グリーンランド – guriinrando
Grenada – グレナダ – gurenada
Guam – グアム – guamu
Guatemala – グァテマラ – guatemara
Guinea – ギニア – ginia
Guyana – ガイアナ – gaiana

Haiti – ハイチ – haichi
Honduras – ホンジュラス – honjurasu
Hong Kong – 香港（ホンコン） – honkon Hungary – ハンガリー – hangarii

Iceland – アイスランド – aisurando
India – インド – indo
Indonesia – インドネシア – indoneshia
Iran – イラン – iran
Iraq – イラク – iraku
Ireland – アイルランド – airurando
Israel – イスラエル – isuraeru
Italy – イタリア – itaria

Jamaica – ジャマイカ – jamaika
Japan – 日本（にほん） – nihon
Jordan – ヨルダン – yorudan

Kazakhstan – カザフスタン – kazafusutan
Kenya – ケニア – kenia
Korea – 韓国（かんこく） – kankoku
North Korea – 北朝鮮（きたちょうせん） – kita chousen
Kuwait – クウェート – kuweeto
Kyrgyzstan – キルギスタン – kirugisutan

Laos – ラオス – raosu
Latvia – ラトビア – ratobia
Lebanon – レバノン – rebanon
Liberia – リベリア – riberia
Libya – リビア – ribia
Liechtenstein – リヒテンシュタイン – rihitenshutain
Lithuania – リトアニア – ritoania
Luxembourg – ルクセンブルグ – rukusenburugu

Macao – マカオ – makao
Macedonia – マケドニア – makedonia
Madagascar – マダガスカル – madagasukaru
Malaysia – マレーシア – mareeshia
Maldives – モルジブ – morujibu
Mali – マリ – mari
Malta – マルタ – maruta
Mauritania – モーリタニア – mooritania
Mexico – メキシコ – mekishiko
Micronesia – ミクロネシア – mikuroneshia
Moldova – モルドバ – morudoba
Monaco – モナコ – monako
Morocco – モロッコ – morokko
Mozambique – モザンビーク – mozanbiiku

Namibia – ナミビア – namibia
Nepal – ネパール – nepaaru
Netherlands – オランダ – oranda
New Caledonia – ニューカレドニア – nyuukaredonia
New Zealand – ニュージーランド – nyuujiirando
Nicaragua – ニカラグア – nikaragua
Niger – ニジェール – nijeeru
Nigeria – ナイジェリア – naijeria
Norway – ノルウェー – noruwee

Oman – オマーン – omaan

Pakistan – パキスタン – pakisutan
Palau – パラオ – parao
Panama – パナマ – panama
Papua New Guinea – パプアニューギニア – papuanyuuginia
Paraguay – パラグアイ – paraguai
Peru – ペルー – peruu
Philippines – フィリピン – firipin
Poland – ポーランド – poorando
Portugal – ポルトガル – porutogaru
Puerto Rico – プエルトリコ – puerutoriko

Qatar – カター – kataa

Romania – ルーマニア – ruumania
Russia – ロシア – roshia
Rwanda – ルワンダ – ruwanda

Samoa – サモア – samoa
San Marino – サンマリノ – sanmarino
Saudi Arabia – サウジアラビア – saujiarabia
Senegal – セネガル – senegaru
Singapore – シンガポール – singapooru
Slovakia – スロバキア – surobakia
Solomon Islands – ソロモン諸島（しょとう） – soromon shotou
Somalia – ソマリア – somaria
South Africa　－南（みなみ）アフリカ – minami afurika
Spain – スペイン – supein
Sri Lanka – スリランカ – suriranka
Sudan – スーダン – suudan
Suriname
Swaziland – スワジランド – suwajirando
Sweden – スウェーデン – suweeden
Switzerland – スイス – suisu
Syria – シリア – shiria

Taiwan – 台湾（たいわん） – taiwan
Tajikistan – タジキスタン – tajikisutan
Tanzania – タンザニア – tanzania
Thailand – タイ – tai
The Bahamas – バハマ – bahama
Tonga – トンガ – tonga
Tunisia – チュニジア – chunijia
Turkey – トルコ – toruko

Uganda – ウガンダ – uganda
Ukraine – ウクライナ – ukuraina
United Kingdom – イギリス – igirisu
United States – アメリカ合衆国（がっしゅうこく） – amerika gasshuukoku
Uruguay – ウルグアイ – uruguai
Uzbekistan – ウズベキスタン – uzubekisutan

Venezuela – ベネズエラ – benezuera
Vietnam – ベトナム – betonamu
Virgin Islands – バージン諸島（しょとう） – baajin shotou

Yemen – イエメン – iemen
Yugoslavia – ユーゴスラビア – yuugosurabia

Zambia – ザンビア – zanbia
Zimbabwe – ジンバブエ – jinbabue

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